Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcc1O35379 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms