Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KeraO35367 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KeraO35367 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KeraO35367 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KeraO35367 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KeraO35367 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KeraO35367 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KeraO35367 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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