Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dgcr6O35347 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms