Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CenpaO35216 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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