Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nedd9O35177 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Nedd9O35177 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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