Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Cldn4O35054 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Cldn4O35054 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Cldn4O35054 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn4O35054 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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