Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Casq1O09165 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casq1O09165 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Casq1O09165 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casq1O09165 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casq1O09165 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms