Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Epha8O09127 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Epha8O09127 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms