Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sypl1O09117 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms