Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap23O09044 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snap23O09044 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms