Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfil3O08750 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nfil3O08750 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfil3O08750 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfil3O08750 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfil3O08750 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfil3O08750 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfil3O08750 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfil3O08750 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nfil3O08750 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms