Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm3239L7N2D9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm3239L7N2D9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm3239L7N2D9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm3239L7N2D9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm3239L7N2D9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm3239L7N2D9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm3239L7N2D9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm3239L7N2D9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm3239L7N2D9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm3239L7N2D9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm3239L7N2D9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3239L7N2D9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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