Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer2J3QPU5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms