Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20795J3QP49 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms