Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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