Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21244J3QK38 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21244J3QK38 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21244J3QK38 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21244J3QK38 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21244J3QK38 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21244J3QK38 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21244J3QK38 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21244J3QK38 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms