Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm21818J3KMS6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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