Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pot1bH7BX60 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms