Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubgcp6G5E8P0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms