Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vmn1r58G3X9U3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms