Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgxb3G3X9M3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms