Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610008E11RikG3X964 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms