Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx1-1G3UXB3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms