Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms