Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl26F8VQM2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl26F8VQM2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms