Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LctF8VPT3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LctF8VPT3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms