Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M1F7CXU4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M1F7CXU4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M1F7CXU4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M1F7CXU4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M1F7CXU4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M1F7CXU4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M1F7CXU4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M1F7CXU4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M1F7CXU4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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