Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm28048F7BCN0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm28048F7BCN0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm28048F7BCN0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm28048F7BCN0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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