Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SmgcF6VRN1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms