Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Zfp988F6VKC7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Zfp988F6VKC7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Zfp988F6VKC7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Zfp988F6VKC7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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