Protein–RNA interactions for Protein: F6TJM2

Gm10065, Predicted gene 10065, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10065F6TJM2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm10065F6TJM2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm10065F6TJM2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10065F6TJM2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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