Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms