Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf165E9QAU8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf165E9QAU8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf165E9QAU8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf165E9QAU8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf165E9QAU8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf165E9QAU8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf165E9QAU8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf165E9QAU8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf165E9QAU8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf165E9QAU8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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