Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cald1E9QA15 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cald1E9QA15 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cald1E9QA15 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms