Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd7E9Q9W7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms