Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Simc1E9Q6E9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Simc1E9Q6E9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms