Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC005561E9Q5E2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms