Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trip11E9Q512 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms