Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms