Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fndc1E9Q043 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fndc1E9Q043 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms