Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20425E9Q035 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms