Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd2E9PZM4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd2E9PZM4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd2E9PZM4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd2E9PZM4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd2E9PZM4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd2E9PZM4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd2E9PZM4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd2E9PZM4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd2E9PZM4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd2E9PZM4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd2E9PZM4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd2E9PZM4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd2E9PZM4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd2E9PZM4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd2E9PZM4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd2E9PZM4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd2E9PZM4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd2E9PZM4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd2E9PZM4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd2E9PZM4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd2E9PZM4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms