Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms