Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms