Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a3E9PWQ3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms