Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gcn1E9PVA8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gcn1E9PVA8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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