Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smpd5D6MZJ6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms