Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930444G20RikD3Z741 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930444G20RikD3Z741 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms