Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms