Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3543D3Z235 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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